La debilidad de los últimos faraones de la primera dinastía, provocó que las diferencias entras las dos tierras brotasen y pronto surgió la guerra entre las dos tierras.
Hotepsejemuy, primer faraón de la segunda dinastía era originario del Bajo Egipto y se impuso por las armas en las dos tierras. Como conquistador trató de imponer en todo Egipto las deidades y costumbres del Bajo Egipto.
Esta política fue seguida por sus sucesores y esto provocó frecuentes revueltas del Alto Egipto hasta que finalmente, estos nombraron sus propios reyes que luchaban constantemente contra el Faraón.
Jasejemuy, el último faraón de la segunda dinastía, logró recomponer la unidad de Egipto, residió en Menfis y Buto y también venció a los nubios
